開館時間は午前9時から午後4時30分(最終入館午後4時00分)までです。
また、定例の休館日はありませんが、年間10日程度の作業休館日と年末年始（12月31日～1月1日）の休館日がありますので、事前にお問い合わせいただくか「寺泊水族博物館ホームページ」でご確認ください。