長岡市内には、次のような指定文化財があります。（令和5年4月1日現在）
【絵　　　画】国指定：0件、県指定：3件、市指定9件
【彫　　　刻】国指定：1件、県指定：8件、市指定37件
【工芸品】国指定：0件、県指定：5件、市指定14件
【書跡・典籍】国指定：1件、県指定：2件、市指定19件
【古文書】国指定：1件、県指定：0件、市指定35件
【考古資料】国指定：4件、県指定：8件、市指定13件
【歴史資料】国指定：0件、県指定：1件、市指定8件
【建造物】国指定：2件、県指定：1件、市指定16件
【工芸技術】国指定：0件、県指定：1件、市指定2件
【有形民俗文化財】国指定：2件、県指定：1件、市指定9件
【無形民俗文化財】国指定：1件、県指定：3件、市指定22件
【史　　　跡】国指定：4件、県指定：6件、市指定34
【名　　　勝】国指定：0件、県指定：0件、市指定3
【天然記念物】国指定：5件、県指定：3件、市指定30件
この他、国特別天然記念物のカモシカとトキ、国登録有形文化財が40件、新潟県選定保存技術が1件あります。

これらの文化財は、冊子「長岡の文化財」（平成26年3月31日発行）に掲載されています。（一冊2,000円、科学博物館等で販売）